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MedeA 기본환경

MedeA 기본 환경 (MedeA Environment)은 결정 구조 모델의 구축 및 결과의 해석을 그래픽 사용자 인터페이스(GUI) 환경을 제공합니다. MedeA는 기본 환경 MedeA Environment를 축으로 계산 프로그램이나 물성치를 추산하기위한 도구(VASP, Phonon, Gibbs 등)를 조합하여 계산 환경을 구성합니다.

MedeA's Builders를 통해 고체 물질(bulk system)의 구조를 설계하는 툴을 제공합니다. 모든 공간 군을 지원하고, 구축 모델의 대칭을 자동으로 파악하는 등 결정 구조의 모델링에 적합한 기능을 가지고 있습니다. Interface와 Surface 구조를 툴을 이용하여 쉽게 설계할 수 있습니다. 또한 다음과 같은 다양한 도구를 탑재하고있어 결함을 만들고 원소의 치환, 삽입 등의 편집, 슈퍼 셀 또는 표면 모델의 설계 등 모델 구조를 자유 자재로 만들 수 있습니다.

Find Empty Space

결정 격자 사이의 빈 공간을 검색하기위한 도구입니다. 삽입형 치환 사이트를 검토하는 데 정보를 얻을 수 있습니다. 수소 저장 합금 재료의 수소 사이트 검색 등에 사용할 수 있으며,다공체 시스템에서의 반응이나 확산 분석에 사용할 수 있습니다.

medea findempty

Molecular Builder

분자 구조를 설계하는 도구입니다. 결정 구조 모델과 결합하여 고체 표면에 분자의 흡착 등을 모델링하는 경우에 유용합니다.

medea molecular

Substitutional Search

대체 사이트를 검색하기위한 도구입니다. 대체 사이트가 여러 사이트 있으면 대칭성을 고려하여 모든 대체 조합 검색합니다. 대체 모델을 만들 때 유용하며, 대체 사이트 사이의 거리도 자동으로 계산합니다.

medea Substitutional

Surface Builder

지정된 밀러면을 잘라 표면 모델을 만들 수 있습니다. 원자 층수 및 진공 층의 크기, 표면의 종단을 쉽게 조정할 수 있습니다. VASP 계산을 위한 표면 시스템을 설계합니다. 대칭분석을 통해 최적의 표면 설계가 가능합니다.

medea Surface

Interface Builder

최적의 기하학적 검색을 통하여 두 계면 사이의 최적의 일치면에 대한 검색 합니다. : 이 모듈은 VASP 또는 다른 계산을 위한 3D 정기 모델을 구성합니다.계면 모델을 사용하기 위해서는 벌크 시스템에서 표면을 잘라, 2 개의 표면간에 격자의 크기와 위치를 조정해야합니다. 이러한 작업을 수동으로 수행하는 것은 매우 복잡한 일이나 Interface Builder를 이용하여 2 개의 표면을 제공하는 것만으로 자동으로 표면의 대칭성을 고려하여 그 표면 사이의 계면 모델을 총체적으로 생성할 수 있습니다.
* Interface Builder는 옵션 도구입니다.

Interface_Builder_Overview_v251.pdf
medea interface

Transition State Search

확산 과정에서 표면에서의 분자의 분해, 위치와 장벽의 높이와 같은 화학반응의 전의 상태의 에너지와 구조를 결정하는 툴이다.
Phonon 모듈과의 결합을 통해 온도 함수의 반응와 jump rates을 계산 할 수 있다.

반응 경로를 통한 Energy profile을 얻는다.
전위 상태의 구조와 energy를 얻는다.
반응 경로를 애니메이션으로 구현 한다.

* Transition State Search는 옵션 도구입니다.

Transition_State_Search_Overview_v251.pdf
medea Transition State